במהלך עבודת הוועדה התחבטו חבריה, אלו מישורים ציבוריים עליהם להדגיש. ראש הממשלה שמעון פרס כתב לנבון בכתב המינוי, כי “הוועדה תהיה רשאית להתמקד בהיבטים מסוימים כפי שתמצא לנכון”. עוד נקראה הוועדה לבחון את השלכות הפרשה החברתיות והציבוריות (עמוד 11 בתיק סיכומי ישיבות + מסמכים, ג-7988/2):
הדו”ח הסופי נמסר לראש הממשלה בנימין נתניהו ב-28 ביולי 1996 (תעודה 55, עמוד 277 בתיק טיוטות דו”ח הועדה, ג-7988/4). למחרת, בדיון ועדת העליה והקליטה בכנסת אודות הדו”ח, אמר נבון: “קראנו לזה פיקוח נפש. זה דחוף, זה חיוני. אינני יודע להגיד משהו קשה יותר מזה” (דברי נבון בעמוד 6 בפרוטוקול).
לבסוף, נתבססו מסקנות הוועדה והמלצותיה, על ארבע ענפי יסוד בחלוקה הבאה: